La réforme de la facturation électronique impose aux entreprises françaises d’adopter des outils conformes dès septembre 2026. Les plateformes agréées, immatriculées par l’administration fiscale, assurent l’émission, la réception et la transmission sécurisée des factures. Plus de 100 solutions existent déjà, mais toutes ne conviennent pas à chaque profil d’entreprise. Ce guide explore les options les plus adaptées aux TPE, PME et indépendants, en se basant sur des critères comme la simplicité d’utilisation, les tarifs et les intégrations. Des acteurs comme Indy ou Qonto se distinguent par leur gratuité partielle et leur focus sur les petites structures. D’autres, tels que Cegid ou Yooz, ciblent les besoins plus complexes des moyennes entreprises. La liste officielle des plateformes agréées est disponible sur le site des impôts. Choisir la bonne plateforme simplifie la transition vers cette obligation légale.
Critères pour sélectionner une plateforme agréée
Avant de lister les solutions phares, examinez les aspects clés qui différencient ces outils. La conformité reste le point de départ : chaque plateforme doit figurer sur la liste des immatriculées sous réserve par la DGFiP. Au-delà, évaluez la facilité de prise en main, surtout pour les non-experts en comptabilité. Les tarifs varient de gratuit à plusieurs centaines d’euros mensuels, selon les volumes de factures. Les intégrations avec des logiciels existants, comme des ERP ou des CRM, facilitent l’automatisation. La qualité du support client compte aussi, avec des options comme le chat en ligne ou les tutoriels. Enfin, vérifiez les fonctionnalités supplémentaires, telles que l’archivage légal ou la gestion des paiements.
Conformité et immatriculation
Toutes les plateformes mentionnées ici sont agréées et immatriculées. Par exemple, depuis janvier 2026, plus de 110 solutions ont obtenu ce statut, selon les mises à jour officielles. Cela garantit leur interopérabilité avec le portail public de facturation et les autres plateformes.
Tarification et accessibilité
Les modèles économiques diffèrent. Certaines proposent un accès gratuit pour les bas volumes, tandis que d’autres facturent par facture traitée ou par abonnement fixe. Adaptez le choix à la taille de votre activité.
Les 10 meilleures plateformes agréées
Voici une sélection des solutions les plus performantes en 2026, classées par popularité auprès des petites et moyennes entreprises. Chaque description met en avant les atouts principaux, basés sur des retours d’utilisateurs et des benchmarks récents.
1. Indy
Indy se positionne comme une référence pour les indépendants et TPE. Immatriculée PA, elle gère la facturation électronique gratuitement pour les bas volumes. Les utilisateurs apprécient son interface intuitive et ses outils de comptabilité intégrés. Avec plus de 50 000 clients, elle excelle dans l’automatisation des déclarations fiscales. Les tarifs démarrent à 0 € pour les fonctionnalités basiques, avec des options premium à 12 € par mois.
2. Qonto
Qonto combine compte pro et facturation électronique. Agréée depuis 2025, elle permet d’envoyer et recevoir des factures sans frais cachés. Idéale pour les startups, elle intègre des paiements directs et un suivi de trésorerie. Les abonnements varient de 9 € à 99 € mensuels, selon les besoins en volume.
3. Pennylane
Pennylane cible les PME avec une approche comptable complète. Comme plateforme agréée, elle automatise la dématérialisation et les rapports. Les points forts incluent des intégrations avec des outils comme Stripe et une collaboration en temps réel avec les experts-comptables. Les prix commencent à 29 € par mois.
4. IPaidThat
IPaidThat excelle dans la collecte automatique des factures via emails ou scans. Agréée PA, elle simplifie la gestion des fournisseurs pour les entreprises en croissance. Les fonctionnalités d’IA pour la reconnaissance optique des caractères accélèrent les traitements. Tarifs à partir de 49 € mensuels.
5. Yooz
Yooz s’adresse aux structures plus importantes, avec une dématérialisation avancée. Immatriculée, elle gère des volumes élevés et assure un archivage sécurisé sur 10 ans. Les utilisateurs soulignent sa robustesse pour les audits fiscaux. Abonnements dès 99 € par mois.
6. Cegid
Cegid, acteur historique, propose des solutions pour tous secteurs. Agréée, elle intègre facturation électronique et gestion financière. Parfaite pour les PME industrielles, avec des modules personnalisables. Les coûts varient, souvent sur devis, autour de 50 € par utilisateur.
7. Tiime
Tiime offre une facturation 100 % gratuite pour les indépendants. Plateforme agréée, elle inclut des apps mobiles pour une mobilité accrue. Les retours mettent en avant sa simplicité et ses exports rapides vers les comptables. Options payantes pour des fonctionnalités avancées à 15 € mensuels.
8. Sage
Sage cible les entreprises matures avec des outils cloud. Immatriculée PA, elle gère la facturation internationale et les normes européennes. Les intégrations avec Microsoft 365 facilitent les workflows. Tarifs à partir de 25 € par mois.
9. Sellsy
Sellsy allie CRM et facturation électronique. Agréée depuis fin 2025, elle automatise les relances et les paiements. Adaptée aux équipes commerciales, avec des dashboards analytiques. Abonnements de 29 € à 149 € mensuels.
10. Axonaut
Axonaut ferme ce top avec son approche tout-en-un pour les PME. Plateforme agréée, elle couvre facturation, stocks et projets. Les utilisateurs valorisent son support français et ses personnalisations. Prix dès 49 € par mois pour cinq utilisateurs.
Comparaison des fonctionnalités clés
Pour faciliter le choix, voici un tableau récapitulant trois aspects essentiels pour ces plateformes.
| Plateforme | Tarif de base (€/mois) | Volume gratuit |
|---|---|---|
| Indy | 0 | Illimité basique |
| Qonto | 9 | 20 factures |
| Pennylane | 29 | 10 factures |
| IPaidThat | 49 | Aucun |
| Yooz | 99 | Aucun |
| Cegid | 50 | 5 factures |
| Tiime | 0 | Illimité |
| Sage | 25 | 15 factures |
| Sellsy | 29 | 10 factures |
| Axonaut | 49 | Aucun |
Avantages de passer à la facturation électronique via ces plateformes
Adopter une plateforme agréée va au-delà de la simple obligation. Les gains en temps se chiffrent en heures hebdomadaires pour les tâches administratives. La sécurité des données réduit les risques de fraude, avec des protocoles comme le chiffrement et les signatures électroniques. Les rapports automatisés aident à optimiser la trésorerie. Pour les entreprises exportatrices, l’interopérabilité avec les normes européennes ouvre des marchés. Des benchmarks montrent que les utilisateurs économisent jusqu’à 30 % sur les coûts comptables annuels.
Étapes pour implémenter une plateforme
- Vérifiez votre éligibilité et les obligations selon la taille de votre entreprise.
- Comparez les démos gratuites des plateformes sélectionnées.
- Formez votre équipe via les ressources fournies.
- Intégrez vos données existantes pour une migration fluide.
- Surveillez les mises à jour réglementaires via les newsletters des plateformes.
Perspectives pour 2027 et au-delà
La réforme s’étendra pleinement en 2027, avec l’obligation d’émission pour toutes les entreprises. Les plateformes agréées évolueront, intégrant plus d’IA pour la prédiction des flux financiers. Des partenariats avec des banques comme Qonto accéléreront les paiements. Restez informé des listes mises à jour, car de nouvelles solutions émergent régulièrement. Ce top reflète l’état du marché en janvier 2026, mais testez personnellement pour un choix adapté.